磁选机与除铁器两者都是磁选设备，两者的共同点都是供助于磁力来区分磁性物料与非磁性物料，但两者在选别方式上是有区别的，除铁器就是用来除铁，就是把物料中含有少量的铁给吸出来，而磁选机主要用于选别金属矿及非金属矿中的物料，适用于含铁量多的物料，需要用磁选机进行选别。磁选机与除铁器的整体结构上是有区别的，外形也是不一样的，除铁器相对来说小巧，制作工艺简单，而磁选机是一台整机，制作工艺复杂。

磁选机和除铁器两者的工作方式不同：

磁选机工作时需要不停转动才能将铁性物质进行挑选。
而除铁器工作时无需动力运作就可以轻松地把铁物质进行挑选，这是两者工作方式的不同。

还有磁选机和除铁器应用行业及应用范围的区别：

应用行业不同
    （1）除铁器主要应用于化学行业、矿山开采、机械业、水泥业、陶瓷业、食品业等行业，在需要除铁器的行业中，用于生产出的材料或者加工制作的原材料中含有少量的体质物料，如果投入到下一个使用环节会对成品或半成品造成影响，需要将这部分少量的铁物质进行挑选剔除，这就用到了除铁器。比如陶瓷行业用于制作陶瓷成品的泥土材料中含有少量的铁物质，使用除铁器除后，保证原材料中无铁物质，以免在后期加工制作中原材料中含有铁物质吸附到机械设备上，还有就是建筑垃圾中的铁钉钢筋除去，也可以使用。
     （2）磁选机主要应用于矿山开采后的矿物质挑选铁性物质，大型矿山开采后物质中含有大量的铁物质，需要将这部分铁物质进行挑选后在投入到生产中，比如常见的矿山有：钛铁矿、磁铁矿、锰矿、碳酸锰矿、氧化锰矿、赤褐铁矿、尾矿、高岭土、黑钨矿、稀土矿、磁黄铁矿、焙烧矿等矿山使用。